แบ่งได้เป็น 2 สาเหตุ คือ สาเหตุภายในตัวฟันและสาเหตุภายนอกตัวฟัน
สาเหตุภายในตัวฟัน ได้แก่
การรับประทานยาปฏิชีวนะ ในช่วงที่อยู่ในครรภ์มารดา โดยเฉพาะอย่างยิ่ง ยาเตตราไซคลิน มักจะทำให้ฟันมีสีคล้ำมาตั้งแต่กำเนิดหรือได้รับในช่วงอายุ 1-7 ขวบ ซึ่งเป็นช่วงที่มีการก่อตัวของตัวฟันอยู่ในกระดูกขากรรไกร ยาปฏิชีวนะจะไปจับกับสารในตัวฟันเกิดเป็นสารที่มีสีขึ้น สีนี้จะติดถาวรในตัวฟัน พันธุกรรม ทำให้สีของฟันเป็นไปตามกรรมพันธุ์ เช่น สีขาว ขาวเหลือง เทา เป็นต้น
โรคประจำตัวเนื่องจากการรักษาโรคแต่ละโรค ต้องใช้ยาและวิธีการรักษาต่างกัน ซึงส่งผลให้เกิดการเปลี่ยนแปลงของสีฟันได้ด้วย
ร่างกาย ที่เสื่อมสภาพไปตามกาลเวลา เป็นสาเหตุให้เกิดคราบสะสมได้ง่ายยิ่งขึ้น
สาเหตุภายนอกตัวฟัน
การทำความสะอาดฟันได้ไม่ทั่วถึง ทำให้เกิดคราบต่างๆ ตกค้างอยู่และก่อให้เกิดคราบหินปูน การดื่มชา กาแฟ และน้ำอัดลม ทำให้เกิดคราบติดอยู่ที่ฟัน การสูบบุหรี่ การซึมของสารจากวัสดุอุดฟันที่มีสีเข้าไปอยู่ในเนื้อฟันเมื่อ มีการสัมผัสโดยตรง
